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製品情報

DNA検索システム GIAS64

GIAS64は64ビット対応し大量データに対応したDNA検索システムです。
弊社はDNA検索システムGIAS(Genetic Information Analysis Service)を提供してきました。大量の塩基配列データの蓄積に伴い、GIASを64ビット対応し、GIAS64 ver 1.0としてバージョンアップしました(2010年4月販売開始)。

GIAS64の特徴
  • ウエブベースのGUIを装備。
  • DeCypherと連携してSmith&Waterman検索を高速に実行可能。
  • FASTA3、NCBI-BLASTを実行可能。
  • 検索対象として、DDBJ、UniProt、PDBに対応。さらにGeneSeqも検索可能。
  • GIASに対してカスタマイズされた機能も引き続き使用可能。
GIAS64トップページ
主な機能
検索対象データベース
検索機能
  • 相同性検索
     ○ Smith&Waterman
     ○ FASTA3(35.04)
     ○ NCBI-BLAST 2(2.2.21)
  • キーワード検索(keysrchexec)
  • アクセッション番号、ローカスによるエントリ取得(getaccexec)

検索画面
データマネージメント機能
  • 検索ジョブの管理
  • 検索結果リスト保存
  • 結果リストを用いた集合演算
  • クエリの管理
検索結果画面
管理機能
  • 検索対象データベースの蓄積
  • ユーザ認証
  • ユーザ管理
エントリ詳細画面


稼働環境
 OS:   RedHat Enterprise Linux 5.x/6.x 64ビット版
遺伝子/タンパク質配列解析システム DeCypher

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